Las investigaciones que desarrolla el Colegio Andino buscan producir conocimiento científico sobre temas centrales en el debate sobre el futuro de la región. Este conocimiento es luego puesto a disposición de la comunidad académica y de la ciudadanía a través de actividades de difusión como coloquios, conferencias, y seminarios de investigación.

De esta manera, se subvierte la clásica distinción entre investigación pura e investigación aplicada. Toda investigación en ciencias sociales contribuye a la transformación social, en la medida de que genera conocimiento y contribuye al debate. El Centro Bartolomé de Las Casas ayuda a los actores regionales a entender mejor los determinantes del cambio en los Andes, y tomar de esta manera las decisiones que ellos consideren pertinentes, en pleno conocimiento de causa.